Grundlagen der Bioinformatik [SS10]


Dozenten:

Prof. Dr. Burkhard Morgenstern

Für:

Studierende der Biologie (Diplom) mit Bioinformatik als Nebenfach und BSc Biologie im Modul Angewandte Bioinformatik II.

Die 4-stündige Vorlesung gibt einen Überblick über die Grundlagen der Bioinformatik; Schwerpunkt ist dabei die genom-orientierte Bioinformatik. Behandelt werden: genetische Kartierung, Genom-Assemblierung, Genvorhersage, paarweises Sequenzalignment und Homologiesuche, multiples Sequenzalignment und phylogenetische Bäume, Beschreibung und Identifikation von Sequenzmotiven, Hidden Markov Models, maschinelles Lernen in der Bioinformatik, Genexpresssionsanalyse und regulatorische Netzwerke.

Termin: Mo 15:15-16:45 Uhr, Do. 10:00-11:30 Uhr
Ort: Mo in MN09, Do in MN05 (beides GZG)

Powerpoint-Folien:

Multiples Sequenzalignment
BLAST
Dialign I
Dialign II
Phylogenie
Substitutionsmatrizen

Skript:

Vorläufige Version des Skripts

Voraussetzungen:

Grundlagen der Molekularbiologie

Literatur:

Wird in der Vorlesung bekanntgegeben.