Applied Bioinformatics [Genomsequenzierung]

Exercises

Lösungen zur Theorie-Aufgabe

1.                                                 2. 
ttcatat                                             ttcatat
 tcatatta                                            tcatatta
       tattag                                           tattag
         ttagtaa                                          ttagtaa
       	     taatcg                                           taatcg
-------------------                                 ----------------
ttcatattattagtaatcg                                 ttcatattagtaatcg

Lösung 1 ist plausibler, da hier eine konstante Überdeckung von zwei erreicht wird; die überhöhte Überdeckung von 3—4 im mittleren Abschnitt von Lösung 2 deutet auf eine kollabierte Sequenzwiederholung hin.


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