Exercises
- Aufgabenblatt (pdf)
Daten
- NC_000964.gbk
- NC_006582.gbk
- NC_006322.gbk
- BS_vs_BL.blastn
- BAM_vs_BS_vs_BL.alignment
- Bacillus_vergleich
- Bacillus_vergleich.backbone
- BAM_vs_BS_vs_BL.islands
- Bacillus_vergleich.guide_tree
- BAM_vs_BS_vs_BL.backbone
- BAM_vs_BS_vs_BL.guide_tree
- BAM_vs_BS_vs_BL
- Bacillus_vergleich.alignment
- Bacillus_vergleich.islands
Theorieaufgabe zu Genomsequenzierung
- Aus der Shotgut-Sequenzierung haben sie die folgenden Sequenzschnipsel erhalten:
tcatatta ttagtaa ttcatat taatcg tattag
Assemblieren Sie die Sequenzen mit einem minimalen Überlapp von 2 BP. Es gibt dazu zwei Möglichkeiten, welche halten Sie für wahrscheinlicher?
Sehen Sie sich zur letzten Aufgabe bitte noch mal Vorlesungsteil 4: Genomsequenzierung an.
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