Grundlagen der Bioinformatik [SS07]

Dozenten:

Prof. Dr. Burkhard Morgenstern, Prof. Dr. Edgar Wingender

Für:

Studierende der Biologie (Diplom) mit Bioinformatik als Nebenfach.
Bioinformatik kann dabei sowohl als biologisches als auch als nicht-biologisches Nebenfach gewählt werden.

Die 4-stündige Vorlesung gibt einen Überblick über die Grundlagen der Bioinformatik; Schwerpunkt ist dabei die genom-orientierte Bioinformatik. Behandelt werden: genetische Kartierung, Genom-Assemblierung, Genvorhersage, paarweises Sequenzalignment und Homologiesuche, multiples Sequenzalignment und phylogenetische Bäume, Beschreibung und Identifikation von Sequenzmotiven, Hidden Markov Models, maschinelles Lernen in der Bioinformatik, Genexpresssionsanalyse und regulatorische Netzwerke.

Powerpoint-Folien:

Multiples Sequenzalignment
BLAST
Dialign I
Dialign II
Phylogenie
Substitutionsmatrizen

Skript:

Vorläufige Version des Skripts

Voraussetzungen:

Grundlagen der Molekularbiologie

Literatur:

Wird in der Vorlesung bekanntgegeben.