BLAST – Basic Local Alignment Search Tool
- BLAST (WikiPedia)
- BLAST-Info (NCBI)
- BLAST-Glossar (NCBI)
- BLAST-Webinterface beim NCBI
Logo-Plot
Konservierte Motive in alignierten Nukleotid- oder Aminosäuresequenzen können mit Hilfe eines Logo-Plots visualisiert werden. Die Basen bzw. Aminosäuren werden als unterschiedlich große Buchstaben entsprechend ihrer positionsabhängigen Häufigkeiten oder ihres Informationsgehalts (Positionsgewichte) dargestellt.
- WebLogo (University of California, Berkeley)
- Informationsgehalt (WikiPedia)
Sehen Sie sich zu den Aufgaben bitte noch mal Vorlesungsteil 8: Musterdefinition und Motivsuche an.
Siehe auch die kurze Zusammenfassung zum Berechnen des Informationsgehaltes.
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