Applied Bioinformatics [File format]

Datei-Formate

Es ist wichtig das einfache Textformat (plain) von anderen Formaten (MS-Word, PDF, Excel, JPG, . . . ) zu unterscheiden. Dateien im einfachen Format können mit einem Texteditor (Notepad, Wordpad, Emacs, Kate, gedit . . . ) angesehn und bearbeitet werden. Andere Formate wie beispielsweise das MS-Word-Doc-Format, können nur mit dem entsprechenden Programm angezeigt werden. Bioinformatische Programme und Web-Seiten erwarten normalerweise Dateien im einfachen Format (oder haben ein Copy&Paste-Fenster, in das man die Daten kopiert).

Das Format einer Datei kann nicht einfach geändert werden indem man das Suffix (»Anhängsel hinter dem Punkt«) ändert: Die Datei text.doc im MS-Word-Format wird also nicht zu einem Bild, indem man sie in text.jpg umbenennt.

Öffnen einer ASCII-Datei mit Texteditor

ASCII (american standard code for information interchange) sollte aus der Vorlesung bekannt sein.

>[org=Pseudomonas aeruginosa] [strain=PAO1]
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Öffnen eines MS-Word-Dokuments mit einem Texteditor

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